همراه با سال نوآوري و شكوفايي، در اجراي طرحهاي پژوهشي نيز نوآوري‌هايي به‌عمل آمده است. به‌منظور نظارت هرچه بيشتر بر حسن اجراي طرحهاي پژوهشي، مراحل اجراي طرحهاي پژوهشي با ساختار جديدي طي خواهد شد. به اين ترتيب، مركز با پژوهشگراني كه خود رأساً مجري طرحهاي پژوهشي هستند (كه معمولاً از ميان پژوهشگران جوان انتخاب مي‌شوند) قرارداد اجراي طرح را منعقد نموده و همزمان با يكي از استادان مجرب به‌عنوان استاد راهنما قرارداد جداگانه‌اي منعقد خواهد نمود. فرد ثالثي نيز به‌عنوان استاد داور به نمايندگي از مركز بر تعامل مجري و راهنما نظارت خواهد نمود. اين فرايند به اجراي هر چه بهتر طرحهاي پژوهشي و اطمينان از نتايج به‌دست آمده كمك خواهد نمود.